有效地预防丝瓜苗期病害。丝瓜苗期病害大多为土传病害，而穴盘育苗是以珍珠岩、炉渣和砻糠灰为培养基质，这些基质本身不带病原菌，并且每次育苗都要更换新的，故能有效地防止苗期土传病害的发生。
缩短瓜苗定植后的缓苗期。土制营养体育成的苗移栽后一般需5～7天才能活棵，而穴盘育成的丝瓜苗由于苗体小，根须短，移栽时受损小，定植后只需2～3天便可转入正常生长。
防止残留薄膜污染。土制营养钵是用塑料薄膜筒套装土制成，瓜苗移植后丢弃在田间的破旧薄膜不易被土壤微生物所降解，年复一年，残留薄膜不但会破坏土壤结构，而且影响了耕翻土地等农事操作。而穴盘育苗用的基质是不结成团块的分散体，具有较高的孔隙度，定植时随瓜苗根系带到田间能起到疏松土壤的作用。
节省用工。土钵育苗每亩定植田需取土约1000千克，还要与砻糠灰、肥料等拌和装体，用工量和劳动强度都很大，在土钵育苗过程中如果丝瓜苗体长势过旺，还要拉钵疏苗。育苗过程中需经常用药防病。而用穴盘育苗，同样的苗数只需育苗基质15千克左右，大大减少了用工量，降低了劳动强度。
提高了棚室利用率。一个40米长、8米跨度的棚室可育土钵苗约2万株；用穴盘育苗，采用63孔穴盘可育苗约7万株，将育苗棚室的利用率提高了3.5倍。另外，土钵育苗从播种至移栽约需占用棚室45天，而穴盘育苗只需25～30天，缩短了15天左右。
