萝卜的主要病害有黑腐病、病毒病，虫害主要有蚜虫、菜青虫、菜螟等。
1、病毒病：发病后出现花叶。叶片皱缩，畸形，植株矮小、根部发育不良，造成严重缺株减产。该病由蚜虫传播，高温（28℃以上）干旱有利于该病发生。防治办法：及早防治蚜虫；高温干旱季节加强肥水管理，增强植株的抗病能力；适期播种；合理轮作。
2、黑腐病：感病后根部维管束变黑，肉质根内部变黑腐烂，造成黑心、空心，有特别臭的气昧。防治办法：防治上应做到与十字花科蔬菜进行轮作；及时防治菜青虫、黄曲条跳甲等害虫；用硫酸链霉素200毫克/千克（相当于0.02%）浓度的药液喷雾。
3、蚜虫：主要危害萝卜的叶。成群聚集在叶的背面和心叶吮吸汁液，使受害叶缘向后卷曲，叶片皱缩，并逐渐失水枯黄，使植株表现矮小，发育不良，直至枯死，此外，还能传播病毒病。防治办法：可用10%吡虫啉可湿性粉剂1000-2000倍液或50%辟蚜雾可湿性粉剂3000-4000倍液喷雾防治。
4、菜青虫：菜青虫成虫产卵于叶子背面，似竖直的麦粒状，孵化后危害菜叶，吃成很多缺刻。随着虫龄增加，危害逐渐加重，有时仅残留叶脉，影响植株生长发育。且粪便污染叶面，传播软腐病。防治办法：应在1-3龄幼虫多时施药防治，用高效B.t乳剂（8000国际单位/微升）1500倍液喷雾，配制药液时加人0.1%的洗衣粉，选轻气温高于15℃的阴天、多云天或在晴天下午4点后施用；或用5%抑太保乳油2000倍液喷雾。
5、菜螟成虫：菜螟成虫产卵于心叶等幼嫩叶片上，孵化后先潜叶危害，2龄后穿出叶面吐丝缀叶危害，使心叶死亡，4-5龄由心叶或叶柄蛀人根部，受害株枯死。防止办法：抓住卵粒盛孵期并初见心叶受害时施药防治，用2.5%功夫乳油2500倍液喷雾；或50%辛硫磷乳油1000倍液喷雾。