辣椒是喜温、需阳光充足、忌湿的作物，在苗期阶段以调节床温、增加光照、合理控制湿度为主。
1、控制床温：出苗前苗床要维持较高的温度和湿度，幼苗出土后，降温的程度以不防碍幼苗生长为主。当真叶露出后，应把床温提高到幼苗生长发育的适宜温度
2、加强光照：必须给予种子、植株充足的光照，保证光合作用顺利进行。为了使苗床多照阳光，改善光照条件，在保温的前提下，对覆盖物尽量早揭晚盖，延长光照时间。在揭膜时，要防止冷风直接吹入苗床，造成幼苗受害。
3、调节湿度：床土湿度过高，可采用通风降湿和撒干土或草木灰吸湿的办法降低湿度。但通风降湿要兼顾保温，要考虑当时的天气状况，以幼苗不受冻害为主。忌傍晚浇水和阴雨天浇水，也忌浇水量过多，造成床土湿度过大。浇水一般在上午9时以前，下午5点以后，忌高温浇水，否则引起生理失调。
4、中耕：幼苗期间，应注意松土，使床土的表层疏松，防止板结，减少水分蒸发，保持床土温度。松土不可过深，避免损伤根系，为防止苗期发生病害，形成高脚苗，结合中耕应扯掉杂草。
5、适当追肥：苗期应以基肥为主，控制追肥。床土不够肥沃，秧苗出现缺肥症状时，应及时追肥。追肥要选在晴天无风的上午10-12时进行，以有机肥和复合肥为主。若用人畜粪尿，必须充分腐熟，并滤渣，浓度以10-12倍水稀释较好；复合肥可用含氮、磷、钾各10%左右的专用复合肥配制，喷施浓度为0.1%，切忌浓度过高，否则易烧苗。
6、病虫害防治：对未进行种子处理、苗床地未进行土壤消毒、整地质量差、播种密度大的苗床地，在移栽前应注意防治病虫害。