甜玉米种植中经常会发生各种生理病害如：秃顶、缺粒和空秆等，如何防治呢？甜玉米生理病害应选用良种、合理密植，人工辅助授粉；适期播种；加强栽培管理；改善土壤环境条件等等。
①选用良种因地制宜选用高产优质，适应性广，抗逆性强的杂优种。如甜单1号、甜玉米2号、扬甜1号、华农超甜玉米等。
②合理密植，人工辅助授粉一般早熟品种每667亩栽4000株，中熟品种3000～3500株，晚熟品种2500～3000株。在有机甜玉米开花吐丝期间，及时进行人工辅助授粉，效果较为显著。
③适期播种有机甜玉米不耐低温，播种过早则出苗期长，出苗率低，苗弱，生理病害严重。一般土温稳定在10℃以上方可播种，武汉及长江流域其他地区，春播在3月下旬至4月上旬，夏播在5月下旬至6月上旬，秋播在7月中下旬。由于有机甜玉米性喜温暖，不耐低温，全生育期要求比较高的温度，最适生长温度18～27℃，而26～27℃有利于有机甜玉米开花授粉。昼夜温差大有利于生长，夜温过高会增加呼吸消耗，不利干物质积累，灌浆期昼夜温差10℃以上有利于高产。
④加强栽培管理及时供应肥水，施足底肥，增施有机肥，以保证生长发育良好，使早穗的分化发育得到充足营养，并喷施高能红钾，以利长根壮秆。
⑤改善土壤环境条件可使用“免深耕”土壤调理剂。“免深耕”土壤调理剂能打破土壤板结，疏松土壤，改善土壤环境条件促进甜玉米根系发育良好，达到根深叶茂，减少老化苗的形成。土壤结构的改良，并通过水的作用，可将地表溶液浓度降低，化肥、农药残留减少，肥料下渗，更有利深层根系的生长，从而达到营养生长与生殖生长平衡，植株抗倒伏能力增强。
在整地施肥时，或播种之前，及时施用“免深耕”土壤调理剂每667亩用200～300g对水80～100kg，均匀喷在地表即可。“免深耕”土壤调理剂从抽雄到成熟期能有效地提高土壤的保水保肥能力，延缓根系衰老，提高授粉率，克服生理障碍，可增产20%～25%。
