沼气发酵的原料主要是人畜粪便和农作物秸秆，经过发酵后的沼液沼渣是一种优质高效的有机肥料，利用沼液沼渣作肥料，不仅大大减少了化肥的用量，而且能增强农作物的抗病能力，减少病虫害的发生。沼渣和沼液都是营养丰富的有机肥。是一种持、速兼备的肥料。施用沼肥可使柑橘甜度提高0.5度－1.0度，增产10%－30%。鉴于沼肥源于动物排泄物和秸秆，因而具有变废为宝、防止污染的作用，是一种真正意义上的“生态肥”，在当前柑橘无公害栽培中提倡结合生态能源建设，大力施用沼肥。
1、做基肥：一般每亩施用1500公斤左右，先将沼液直接洒在地面，然后翻耕。连续使用三年可使田地的活土层增加6厘米左右，每年提高产量10%以上。
2、做追肥：一般每亩用量1000—1500公斤，可以直接开沟挖穴浇灌作物根部周围，并覆土以提高肥效，灌区也可结合农田灌溉，把沼渣沼液加入水中，随水均匀施入田间，一般可提高产量5—10%。
3、沼渣与过磷酸钙堆沤：每公斤沼渣和5公斤过磷酸钙搅拌均匀，堆沤腐熟7天，能提高磷素活性，有明显的增产效果。一般做基肥亩用量500—1000公斤，可增产粮食或蔬菜15%。
