一、主要病害
1、褐斑病：叶片上出现小点状圆形褐色斑点，边缘细齿状，直径0.5－3mm，互相多不汇合，后期病斑上出现淡褐色盘状增厚物，多生于叶面上，茎部病斑长形，黑褐色，边缘完整，病斑多发生于下部茎叶。
2、黑茎病：发病初期叶上出现小的褐色病斑，后期病斑散开联接在一起，呈纶纹状。茎上发病使茎的大部分变黑。
3、锈病：叶两面，主要是在叶面下面先出现小褐绿斑，隆起呈疱疹状，灰绿色，后期表皮破裂呈现棕色粉末状。
4、白粉病：病株叶面、茎、荚果上出现白色蛛丝状霉层，起先小而呈圆形，后扩大汇合覆盖大部分叶面，病斑呈白粉状。后期霉层出现淡黄至黑色的小点。
防治措施：
1、选择耐病、抗病能力强，适应性强，再生能力强的优良品种。
2、掌握紫花苜蓿生长生活习性，在栽培管理中，
①注意排水，苜蓿虽喜水，但最忌积水，过多积水会造成植株大批死亡，排水通畅才能保证植株良好生长，
地下水位最少应在1米以下。
②苜蓿对氮、磷、钾等营养元素的吸收量很大，在分蘖、拨节、现蕾以及每次刹割以后合理施肥，增加植株抗性，加快再生。
③杂草防除，杂草不但与苜蓿争水、争肥、争光、影响草品质和产量，有些杂草能够产生有毒物质或生长抑制物质，影响苜蓿生长。
④合理的刹割时间和次数及越冬前最后一次刹割的留茬高度都会影响苜蓿的再生和草品质，在第一朵花出现至1/10开花或根茎上又长出大量新芽阶段，进行刹割。此时干物质和营养总量处于最佳状态，营养物质含量高草产量高，根部养分蓄积多，再生性好，草层持久性强。刹割次数以一年3－4次为宜。即利于提高产量和品质又可持续生产。
3、利用高效低毒药剂的防治。在发病初期喷施200倍波尔多液，75％的代森锰锌500－750倍液。发病期用12.5％粉锈宁2000倍液，可治褐斑病、锈病、白粉病、黑茎病等病害。
