光照能促使马铃薯发芽，增加薯块内茄碱苷含量。正常薯块的茄碱苷含量不超过0.02%，对人畜无害，但薯块照光或发芽后，茄碱苷含量急剧增高，对人畜都有毒害作用。因此马铃薯应在黑暗条件下贮藏。
种薯贮藏要求：
①温度。马铃薯在贮藏期间与温度的关系最为密切，作为种薯的贮藏，一般要求在较低的温度条件下贮藏，可以保证种用品质，使田间生育健壮并取得较高的产量。贮藏初期应以降温散热、通风换气为主，最适温度应在4°C;贮藏中期应是防冻保暖，温度控制在1〜3°C;贮藏末期应注意通风，温度控制在4°C。
②湿度。在马铃薯块茎的贮藏期间，保持窖内适宜的湿度，可以减少自然损耗和有利于块茎保持新鲜度。因此，当贮藏温度在1〜3°C时，湿度最好控制在85%〜90%之间，湿度变化的安全范围为80%〜93%，在这样的湿度范围内，块茎失水不多，不会造成萎蔫，同时也不会因湿度过大而造成块茎的腐烂。
③空气。马铃薯块茎的贮藏窖内，必须保证有流通的清洁空气，以减少窖内的二氧化碳含量。如果通风不良，窖内积聚太多的二氧化碳，会妨碍块茎的正常呼吸。比如在我国的北方，如果种薯长期贮藏在二氧化碳较多的窖内，就会增加田间的缺株率和造成植株发育不良，结果导致产量下降。通风又可以调节贮藏窖内的温度和湿度，把外面清洁而新鲜的空气通入窖内，而把同体积的二氧化碳等气体排出窖外。
