稻曲病的综防措施如下：
(1)选用高产抗病品种：一般来说，散穗型、早熟品种发病较轻；密穗型、晚熟品种发病较重。
(2)选用无病种子，做好种子处理：播种前结合盐水选种，淘汰病粒，用57°C温水进行温汤浸种10分钟后，洗干净催芽播种；或用生石灰0.5千克加水50千克，浸稻种30〜35千克（可与恶苗病防治相结合），浸种时间一般为15〜20°C条件下4〜5天，石灰水应高于稻种，使稻种始终淹在水层下。
(3)早期发现病粒应及时摘除，重病地块收获后进行深翻，以便菌核和曲球在土中腐烂，春季播种前，清理田间杂物，以减少菌源。
(4)适量施用化肥，防止过多过迟施用氮肥，氮、磷、钾配合使用，氮肥采取基、蘖、穗肥各1/3,不要过多施用穗肥。
(5)药剂防治：以水稻抽穗前7〜10天为宜。如预测稻曲病为流行年，可于破口初期，每667米2用12.5%纹霉清水剂400〜500毫升；或12.5%克纹霉水剂300〜450毫升；或5%井冈霉素水剂400〜500毫升，对水37.5千克喷雾。若为一般发生年，上述生物药剂可减至每667米2300毫升，对水喷雾。
