不同肥力的土壤施肥料的要求是不一样的。如果土壤肥力较好，亦有利于水稻的生长发育，则只需要常规的农家肥和商品化肥的配合施用，以农家肥和商品化肥中的磷、钾肥作面肥（移栽前的耙田时施用），而氮肥主要用作追肥；如果土壤肥力整体较低，则应适当加大农家肥的施用量，促进土壤肥力的提高。
在生产中，另外一个值得注意的问题是应考虑土壤肥力的不均衡性和根据种植水稻品种种类特别的要求所进行的施肥料。这就要应用土壤普查和土壤肥力监测结果。如果是处于缺磷地带的土壤，则应增加磷肥的施用量。由于磷肥极易被土壤所固定，在施用时要尽量减少与土壤的接触面，宜集中施用或与有机肥料一起堆沤、使磷肥的表面附上一层胶质包被后施用。如西南稻区的一些农民，将磷肥用于蘸秧根（处理前发酵过的磷肥用塑料盆装着，插秧前将秧根在磷肥中蘸一下后再插入大田）或施球肥（将磷肥与有机肥料料制成球状，然后插入水稻的株穴间），亦是十分有效的方法。
我国土壤含钾量总的来说相对较多，但分布不均。总的趋势是由东到西、由南到北土壤含钾量逐渐增加。西南地区含钾较少，西北地区含钾量较多。就土类而言，广东、福建沿海平坦地的砖红壤含钾量，江西、湖南、浙江西部和湖北低丘陵分布的红壤以及江淮丘陵地黄棕壤含钾量中等，四川、湖南分布的紫色土和山东、安徽、四川、甘肃、陕西分布的褐土含钾量较多，东北北部的黑土含钾量。如就全钾含量来分，凡是大于2.2%的属高含量，1.4%～2.2%的属中含量，1.4%以下的属低含量。土壤钾若大于100毫克/千克则为充足，51～100毫克/千克为中等，31～50毫克/千克为缺钾，小于30毫克/千克为极端缺钾。由于杂交水稻需钾量高于常规水稻，多年的杂交水稻种植加大了土壤钾素的消耗速度，尤其要注意补充。根据生产实践，在土壤钾含量大于100毫克/千克的情况下种植杂交稻仍然可以大胆使用氯化钾，只是用量酌减，一般每677平方米用量7～10千克。
在氮、磷、钾三要素中，氮素营养的重要性是生产者早认识的。施用氮素化肥也不能一概而论。如果土壤肥力好，水稻品种的耐肥一般（如穗数型品种），则要酌情施用，施用量不能太大；如果土壤肥力较差，而水稻品种的耐肥性能较好（如大穗型品种），则可以适当加大施用量。此外，施肥料时还需要考虑土壤的保肥能力，才能科学决策。如沙土的保肥能力差，就应以少量多次的方式施用，而黏土和有机质含量高的土壤保肥能力强，一次的施用量就可适当增加，而适当减少施用次数。
