有机肥肥分受损的原因有很多种，有的是储藏的原因、有的是使用过后经过自然灾害的原因，自然问题我们无法改变们那就从我们能够人为改变的方面来降低有机肥肥分的减少。
1、防气体挥发造成的养分损失：主要是指在腐熟过程中有机肥中的氮会转化成氨气，造成挥发损失。像鸡粪、人粪尿，在腐熟过程中若不加覆盖，氮素损失非常严重。所以在腐熟的时候一定要用无破损的塑料薄膜覆盖严密。并且堆积腐熟时间切不可过长，腐熟完毕后尽快使用。
2、防随水渗漏的养分损失：像稻壳粪、鸭粪、牛粪等，有的老百姓为了容易腐熟往往在堆成堆后往上面浇水。但是底下没做好防渗漏的措施致使营养元素就会随着浇上去的水流失了。所以无论是用粪坑还是在平地上腐熟，下面一定要铺设塑料薄膜阻挡养分随水渗漏。洒水一定要适量。
3、防化学反应造成的养分损失：人粪尿和草木灰就是个例子。现在仍有不少的菜农为了防止人粪尿引来苍蝇或发出异味就在人粪尿里倒上些草木灰。草木灰是含有大量碳酸钾的，pH值显碱性；而人粪尿属酸性有机肥，所以二者相遇，酸碱中和，养分大量损失。因此，在积肥造肥工作中，应做到人粪尿和草木灰分开来，各自单积、单存、单用，切忌将草木灰倒入有机肥中，同时还要防止草木灰被雨水淋失。
另外，在有机肥堆制腐熟时加入适量的过磷酸钙可起到保持肥效的作用。
