对棉花苗床进行消毒处理，应该依据本地棉花发生病害的情况以及防治重点科学选择杀菌剂。在播种棉花播之前需对苗床土壤进行严格消毒处理，只有这样做才可以有效的避免流行发生病害。
通常来说，使用杀菌剂对棉花苗床土壤进行处理，主要是为能够有效的防治棉花的猝倒病、立枯萎病、枯病、炭疽病以及黄萎病等病害。经常用于对苗床土壤进行处理的杀菌剂主要有多菌灵、敌克松以及恶菌灵等。络氨铜、甲基硫菌灵、菌毒清、强氯精、五氯硝基苯含福美双、含福美双以及拌种灵等农药，用来拌作物种子处理以及在棉花苗期喷淋，也可以起到非常好的土壤消毒作用。下面小编给大家详细重点介绍如下两种：
1、菌立停。此药剂是从海带中经过处理提炼而来的精碘加助剂。菌立停的杀菌谱广，不管是真菌、细菌还是由病毒而所导致的各种病害都具有非常好的防治效果，长期应用该药剂不会产生抗药性，能够有效的防治棉花的立枯病、炭疽病以及枯萎病等病害。该药剂的杀菌机理比较独特，杀菌的速度仅仅需要几秒钟，由于它是一种带负电荷的杀菌剂，它的本身具有很强的渗透性特点，而病菌通常都是带有正电荷的，通常杀真菌仅仅需要7秒，细菌3到4秒，病毒10秒就能够杀灭。用于棉苗病害，可以用稀释液1000到1500倍液向苗床土壤进行灌根，效果非常好。
2、稻脚青主要用于棉花幼苗的炭疽病以及立枯病。主要抓好营养钵土以及盖籽土的消毒处理。通常使用百分之二十的稻脚青可湿性粉剂配制成百分之零点三到百分之零点四的药液，将营养土钵给浇湿，并且使用祥通浓度的药液对盖籽土进行喷雾。
