障碍型冷害主要指的是从幼穗形成期到抽穗开花期，特别是水稻减数分裂期短时间遇到日平均气温17度以下低温，使花器的分化受到破坏，花粉败育，不能授粉造成空壳；如果在抽穗开花期遇到低温，可造成颖花不开，花药不开裂，花粉不发芽，形成空粒。这种冷害一旦发生，只能采取措施减轻危害，无法避免，属由异常低温引起的自然灾害。减轻障碍型冷害的主要措施是在7月中下旬注意收听天气预报，如发现异常低温趋势，马上采取深灌20cm以上水层护胎或可采取地头放烟等措施，提高温度。栽培技术上多施有机肥、磷肥、钾肥，少施氮肥，种植抗冷品种，稀植栽培等措施来减轻障碍型冷害的危害。
