苹果树干腐病危害枝干和果实，大的枝干被害，初期病斑呈暗褐色，形状不规则，表面湿润，常有褐色黏稠状液体冒出。后期失水后，干缩凹陷、开裂，易翘皮，病皮表面密生小黑点。细弱枝被害，病斑呈紫色或暗褐色，并迅速沿枝干纵向扩展，枝条很快干枯死亡。果实被害，初期果实产生黄褐色小点，然后逐渐扩大成轮纹病斑，严重的可使全果腐烂。
该病菌来源于枝干病斑或枯死枝，枯死枝包括树上、树下、果园周围及树上的枯桩、干橛等，经风雨传播，由伤口、死芽和皮孔侵入。枝干于5月下旬开始发病，6-8月为第一发病高峰期，7月份雨季来临后，病势减弱，10月为第二发病高峰期。该菌有潜伏侵染的特性，当树体衰弱或树皮水分低于正常情况时，迅速发病，10米内距离传播很快。
防治干腐病，一是加强栽培管理。首先，利用冬剪去除病弱枝和枯死枝，然后彻底清洁果园，将枯枝落叶集中烧毁或置于离果园50米以外的地方。二是增施有机肥，及时浇水，增强树体的抗病能力。三是防治枝干害虫，避免造成各种伤口（包括冻伤、虫伤、机械损伤等）。四是通过修剪和疏花、疏果等措施，使树体合理负荷，避免大小年现象，保持树势稳定。对发病的弱树、幼树，可用病伤一抹灵或菌毒清直接涂于患处。对于较大的枝干，可把病斑刮除后涂抹10-20倍液的农抗120。
有苹果树干腐病的果园，应于发芽前喷3-5波美度石硫合剂或轮纹病铲除剂400倍液。于第一发病高峰前（5-6月）喷2次戊唑醇或退菌特800倍液。
