1、选用抗病品种不同番茄品种间抗病性有一定的差异，例如中粉一号、粉皇后、成功者、中杂9号等都高抗二种疫病，在栽培时要优先考虑选用这些抗病品种。另外，还要根据茬口或地域的适应性，适当选种，露地栽培要选露地专用型品种，早熟栽培的不可选晚熟品种，气候潮湿地区或雨水偏多年份更要选高抗疫病品种。
2、种子处理防治疫病要从各个细节抓起，对种子进行消毒便是很关键的一点。首先将种子用70%代森锰锌可湿性粉剂500倍液喷洒，尔后放在55℃的水中浸种30min，沥水后则可催芽。
3、实行轮作因留在栽培地里的病残体是越冬的初侵染源，所以拉秧时不需要清除地面病叶、病果，而且为避免因病菌积累引超突然大发生，应采取与非茄科蔬菜进行2-3年轮作。
4、药剂防治在疫病大范围发生时，喷洒农药是防治疫病最有效的方法，但要注意喷洒药液要及时、周到，以防为主。常用的药剂有：58%甲霜灵锰锌可湿性粉剂500倍液、60%杀毒矾可湿性粉剂500倍液、75%百菌清可湿性粉剂600倍液、50%多菌灵可湿性粉剂500倍液；防治早疫病还可用50%扑海因可湿性粉剂1000-1500倍液、70%代森锰锌可湿性粉剂500倍液等。防治晚疫病可用77.2%普力克水剂800倍液。茎部病斑可用高浓度药液涂抹，可选用75%百菌清可湿性粉剂100倍液，50%甲基托布津可湿性粉剂200倍液。不管是病叶喷药或病茎涂药，每7-8天1次，连续2-3次，但要注意施药后10天不可摘果上市。
