一、因地制宜选用抗病品种。
二、适当调节播种期，尽可能使该病发生的高峰期，即玉米孕穗至抽穗期，不要与雨季相遇。
三、加强田间管理。发病后注意开沟排水，防止湿气滞留，可减轻受害程度。
四、药剂防治。
1、5％井冈霉素水剂，每667m2用药50-75mL，对水75-100L或用50％甲基硫菌灵可湿性粉剂600倍液、50％多菌灵悬浮剂700-800倍液、50％苯菌灵可湿性粉剂1500倍液、40％农利灵可湿性粉剂1000倍液。视病情防治1次或2次。
2、在干旱缺水地区每667m2用20％井冈霉素可湿性粉剂或40％多菌灵可湿性粉剂200g制成药土在玉米大喇叭口期点心叶，防治玉米穗腐病，防效80％左右。
