随着气温的降低，丝瓜在生长期间会有病虫要害的侵袭，主要病害有病毒病、霜霉病和白粉病、灰霉病、菌核病和性软腐病都是危害丝瓜的病害。
在管理丝瓜中药以预防疾病为主，进行综合，避免茎叶受病菌的危害。天气晴好时，用普力克722克/升霜霉威盐酸盐水剂600倍液防治疫病、霜霉病，用40%嘧霉胺悬浮剂（800倍液）混加3%多抗霉素水剂（500倍液）防治灰霉病、菌核病，用DT30%琥胶肥酸铜可湿性粉剂（500倍液）混加72%农用硫酸链霉素可溶性粉剂（3000倍液）防治性病害。阴雨天用熏烟剂防治病害。喷施磷酸二氢钾300倍液、氨基酸液肥500倍液等混加爱多收1.8%复硝酚钠水剂6000倍液，也是保护叶片的重要手段。
病毒病，霜霉病和白粉病，发生时可用甲霜灵，三唑酮喷雾防治，每隔7天喷一次，连喷2—3次。虫害主要是蚜虫、瓜消螟，皮守瓜等，防治上可用乐果800倍液，5％卡死克1000倍液喷杀。
