种子萌发时，根与芽生长是两种不同的生长方式。芽的生长主要是胚芽鞘细胞伸长，它没有新细胞的形成，只要有充足的水分，有氧无氧都可以进行，而且在无氧条件下比有氧条件伸长更快，持续时间较长。而胚根的生长，虽然也有细胞的伸长，但主要靠细胞分裂方式进行。细胞分裂需要大量的蛋白质等有机物质供应，这些物质转化和参与合成新器官，又需要提供一定能量。没有充足的氧气供应，呼吸作用受到限制，细胞分裂不能进行，根也就无法生长，所以有氧长根，无氧长芽，干长根，湿长芽的说法是有道理的。在生产上，秧苗前期管理要处理好秧苗扎根与立叶的关系。在秧田管理中，芽期必须坚持湿润，不大水漫灌和不淹水，坚持浇水。
