过去由于供给不足，农业生产盲目追求高产量，疏于对农产品质量的管理。长期大量施用单质化肥，土壤有机质匮乏，农产品品质下降。大棚蔬菜和反季节果蔬繁荣了市场，但因生长期短，营养和口感自然下降。有的农民为抢销售期，增加化肥、、农药，导致农产品超常生长。科技是把双刃剑，它提高了农产品的产量，但也使农产品变了质。据北京市农委资料，在北京市场农产品抽查中发现，有18%的农产品有害残留超过国家规定标准。
现在，我国每年使用化肥4200万吨，平均每公顷土地施用量超过400公斤，大大超过美国和欧洲每公顷使用225公斤的标准。化肥在土壤中的残留相当严重，酸雨、硫和重金属对土壤、农作物和水源形成污染，造成农产品中的有毒物质超标。比如龙井茶的出口因为“铅超标”受到严格限制。要解决化肥对农产品的负面作用，就必须减少化肥的施用量，增施微生物肥料、生物有机肥等新型肥料，从根本上解决化肥的污染。去年我国的蔬菜总产量高达4.4亿吨，人均占有350公斤，而人均实际消费仅100公斤左右，约有70%的菜终扔掉和烂掉了。导致蔬菜滞销，除了总量供过于求外，一个重要因素是食品问题。
