黄瓜属浅根系，入土浅，主要根群分布在15～25厘米的土壤表层内。根系再生能力弱，吸收能力差，对氧要求严格。表层土壤空气充足，有利于根系有氧呼吸，促进根系生长发育和对氮磷钾等矿质养分的吸收。因此，黄瓜定植时宜浅栽，切勿深栽。正如农谚“黄瓜露坨，茄子没脖”所说。定植后勤中耕松土，促进根系生长是有科学依据的。
黄瓜根系木质化程度高，发生木质化时间早，伤根后难以再生。因此，黄瓜定植时，要护好根，保护幼苗土坨完整，可提高成活率，缩短缓苗期，为早熟高产奠定基础。
黄瓜茎基部有生不定根的能力，尤其是幼苗，生不定根的能力强。不定根有助于吸收肥水。因此，栽培上常有“点水诱根”之说。在栽培过程中，茎基部经常形成一些根原基，采取有效措施，创造适宜诱根环境，促其根原基发育成不定根，有助于植株生长发育。
黄瓜原起源于土壤肥沃、疏松且常处于湿润状态的热带雨林地区。因此，栽培黄瓜首先应选择富含有机质、松软、保肥保水能力强的土壤，适应中性偏酸、pH5.7～7.2的土壤。黄瓜喜肥但不耐肥，施肥过量，尤其是化肥过量，水分不足时易引起烧根。因此，种植黄瓜宜以有机肥作基肥为主。在追肥时应掌握多次少量的原则。若追肥间隔期间过长，易发生脱肥，一次追肥过多，根系吸收不及，易造成肥分流失。
无公害黄瓜生产立地条件应选择大气、水质、土壤条件均符合无污染绿色食品产地生态环境质量标准。
