1.适期定植，提高根系活力目前主栽的大果型品种以8～9叶苗初现花蕾定植为好，过小不利于开花坐果，过大则影响根系生长，以11月下旬前定植较合理，太迟则在定植后易碰到连续低温，引发根腐病。
2.加强保温，预防根系受冻大棚番茄越冬除了外棚应用6～8S多功能膜外，在1～2月还要在棚内加盖2层3S的多功能膜并确保晚间的严密覆盖。在11月中旬的调查中我们也发现根腐病重发田块的保温条件都较差，从而导致根系受冻，为病菌的侵染创造了条件。
3.选用良种一般来说，现在的当家品种与原来的常规品种相比，其生长势、耐寒性、耐湿力都有了明显的提高，而目前的当家品种抗病性也存在较大的差异，其中“宝大906”和“合作908”这两个品种根腐病的发生率最低，低温状态下生长较为正常。
4.加强肥水管理要控制基肥，合理追肥。基肥一般每亩施45%三元复合肥50公斤、腐熟有机肥1000公斤；在盛果期每亩追施三元复合肥5～10公斤。用水上要前控后促，前控是指定植活棵后适当控制用水，确保枝叶健壮及根系发育，后期加强肥水保丰产。
5.抓住感病生育期，用药控制根腐病流行（1）连作田块定植时用40%乙膦铝锰锌500倍液作定植活棵水。（2）连续低温阴雨后，抢晴用甲霜灵800倍液灌根，每株50～100克。（3）根腐病初发期用农利来700～800倍液灌根，每株100～150克。
