整枝摘心是甜瓜栽培管理的关键性技术措施，生产上常用的整枝摘心方法根据甜瓜生长习性要求有子蔓双蔓、子蔓三蔓、子蔓四蔓、孙蔓四蔓和子蔓孙蔓同时留瓜。
子蔓双蔓整枝：子蔓整枝法适用于子蔓结果的品种。双蔓整枝就是当幼苗3片真叶时主蔓摘心，然后选留两根健壮子蔓任其自然生长，不再掐尖。这种方法能促进早熟，但产量低，密植早熟栽培时多用此法。
子蔓三蔓整枝：与子蔓双蔓整枝方法相似，不同的是每株留3条有效子蔓，达到一株三个瓜的目的。
子蔓四蔓整枝：这是常用的整枝方法。当幼苗5片真叶时，留4叶摘心，促4条子蔓早发生，利用子蔓结瓜，子蔓任其自然生长，一般不再摘心。或者子蔓结瓜以后，在瓜的上部留3-4片叶摘心，并除掉其他无用的枝杈。
在上面三种整枝过程中，如发现某一子蔓没坐住瓜时，应在子蔓上留3-4叶掐尖，促发孙蔓，再利用1-2条健壮孙蔓结瓜，孙蔓结瓜后，不再掐尖。
孙蔓四蔓整枝：主要用于孙蔓结瓜的品种。当主蔓4-5片真叶时，留4叶摘心，并除去基部两条子蔓。待第3和第4两条子蔓长到4-5片叶时摘心，并摘除子蔓基部第1、2孙蔓，每个子蔓上只保留上部第3和第4孙蔓，全株共留4个孙蔓，每个孙蔓上留1个瓜。当孙蔓长到一定长度时，在瓜前边留2-3片叶摘心，其余枝杈一律摘除。
子蔓孙蔓同时留瓜：瓜苗长到4叶1心时摘心，把第一侧蔓疏掉，留上面的三条侧蔓，侧蔓长到三叶时摘心，在第二、三条侧蔓上留2个瓜，以后在孙蔓上留3个瓜。
在生产中，可根据植株的疏密度和结瓜多少等情况，灵活应用整枝技术。瓜田局部植株过密时，宜采用双蔓或三蔓整枝法，使株密而蔓稀。植株太稀时宜采用多蔓整枝方式，做到株稀而蔓密，调节瓜蔓的疏密度和结瓜数。总之，在一定整枝方式的基础上，针对田间瓜苗的具体情况，采用因株整枝的作法是提高产量的有效方法。
整枝摘心必须及时，一旦延缓难以补救，但整枝摘心也不应过早过狠。摘心时最好用镊子把生长点摘除，这样伤口小愈合快，并且可避免损伤侧蔓的生长点。
