菠菜霜霉病主要伤害叶片，病斑从植株下部向上扩展，病斑刚开始的时候呈淡黄色，扩大后呈不规则形，边缘不明显，叶背病斑上产生灰白色霉层，后变灰紫色，发生严重时，病斑互相连结成片，后期变黄褐色枯斑。如果遇到湿度较大的雨天，菠菜将会变褐，腐烂，甚至整株叶片都会变黄枯死。
菠菜霜霉病发病的适生育时期是菠菜5片叶以上时，发病高峰期为春季三四月和秋季九到十二月之间，一般春季雨水较少较小发病轻，秋季雨水多且雨水重发病就重。常年连作地块，与其他常发霜霉病蔬菜邻作或连作，当地势低洼、易积水、播种密度过大田间郁闭、通透性差时发病较重。
菠菜霜霉病的防治方法可以从四个方面着手。一是与茄果类等非绿叶菜类蔬菜轮作2到3年；二是施足腐熟的有机肥，适时播种，合理密植；三是适量浇水，雨后及时排水，降低田间湿度，铲除田间和地边杂草，收获后及时田间病残体；化学防治主要两个阶段，在发病初期可采用下列剂或配方进行防治：560g/L嘧菌·百菌清悬浮剂2000到3000倍液；52.5％恶酮·霜脲氰水分散粒剂1500到2000倍液；76％霜·代·乙膦铝可湿性粉剂800到1000倍液；70％丙森锌可湿性粉剂600到800倍液；72％甲霜·百菌清可湿性粉剂600到800倍液；对水喷雾，视病情隔7到10天喷1次；田间较多株发病时，应加强防治可采用下列剂或配方进行防治：687.5g/L霜霉威盐酸盐·氟吡菌胺悬浮剂800到1200倍液；250g/L吡唑醚菌酯乳油1500到3000倍液；66.8％丙森·异丙菌胺可湿性粉剂600到800倍液；84.51％霜霉威·乙膦酸盐可溶性水剂600到1000倍液；50％烯酰吗啉可湿性粉剂1000到1500倍液加上75％百菌清可湿性粉剂600到800倍液；440g/L双炔·百菌清悬浮剂600到1000倍液；68％精甲霜·锰锌水分散粒剂800到1000倍液；25％烯肟菌酯乳油2000到3000倍液加上75％百菌清可湿性粉剂600到800倍液；对水喷雾，视病情隔5到7天喷1次。农药要交替施用，防止产生抗药性。
