蔬菜棚室在建造时，为方便操作，多是将地表层的熟土用挖掘机挖起后，用于堆砌棚墙，而用来种植蔬菜的土壤多是距离地表较深的生土，这样的土壤有机质缺乏，因此要大量补肥。
一、三增
1.增加粪肥的施用量。新建棚室多是生土，有机质缺乏，因此要大量补充有机肥，如鸡粪等，可以将亩用量提高到15～20立方米，有机肥施用后，虽不能迅速增加土壤中的有机质，但却可以在一定程度上改善土壤的理化性状。
2.增施生物菌肥。新建的大棚，土壤中的各种微生物含量较少，即使将大量的鸡粪、稻壳粪等有机肥施用到大棚土壤中，也因为土壤中缺乏微生物，不能快速地将有机肥分解转化成土壤有机质。因此，菜农在新建大棚土壤中施用有机肥时，一定要注意增施生物菌肥，如每亩地基施激968、大源落地生根抗死棵等生物菌肥40～70公斤，以快速补充土壤中的微生物。
3.增施商品有机肥。商品有机肥的有机质含量高，使用后有助于土壤快速地补充有机质。菜农可以在次往新建大棚土壤中施用粪肥后，配合施用商品有机肥。
二、二补
1.注意补充化肥。新建大棚土壤多是生土，土壤中的氮、磷、钾含量较低，所以在施用基肥时一定要注意增施氮、磷、钾肥料，一般来说，每亩用三元复合肥50公斤左右。
2.注意补充中微量元素。蔬菜要健康生长，不仅需要氮、磷、钾等大量元素，还需要钙、铁、硼等10余种中微量元素。新建大棚土壤中缺乏中微量元素，已经成为制约蔬菜高产优质的突出问题。菜农建好棚室后，要注意增施钙、镁肥，可以亩施100公斤钙镁磷肥或过磷酸钙等，以补充土壤营养。此外，蔬菜的生长还需要铁、锰、硼、锌、铜、钼等数种微量元素，菜农可以施用多元素矿物肥，如禾蔬源复合植物全营养矿物元素肥等，亩用50公斤左右。
