1、缺氮时施用堆肥或充分腐熟的有机肥，采用配方施肥。施用硝态氮效果更好。根据辣椒苗期、初果期和盛果期等不同时期施肥。
2、缺磷育苗期和定植期要施足磷肥，培养土中要求有五氧化二磷，也可叶面喷施磷酸二氢钾或过磷酸钙。
3、缺钾在多施有机肥基础上，施足钾肥，可沟施硫酸钾、草木灰，施后覆土，也可叶面喷洒磷酸二氢钾。
4、缺钙施用适量石灰，应急时叶面喷洒水溶钙每3～4天1次，此外，施用植物生长调节剂（芸苔素内酯）。
5、缺硫时施用硫酸铵等含硫的肥料。
6、缺硼叶面喷洒硼砂水溶液。
7、缺锌土壤不能施磷过量，叶面喷施硫酸锌水溶液。