赤霉病主要为害小麦穗部，在小麦生长的各个阶段均可侵染为害，尤其是扬花期侵染最重。苗期侵染引起苗腐，中后期侵染引起秆腐和穗腐，尤其是穗部受害最重。一般在扬花期侵染，灌浆期显症，成熟期成灾。病菌先侵染的部位主要是花药，其次是颖片的内侧壁。侵染初期在颖壳上呈现边缘不清的水渍状褐色斑，逐渐蔓延至整个小穗，随即病小穗枯黄。湿度大时，病斑处产生粉红色胶状霉层。后期在小穗病部出现粉红色胶质霉层，近而产生密集的黑色小颗粒（即病原镰孢属真菌的子囊壳），用手触摸有突起感，不能抹去，籽粒干瘪并伴有粉红色霉层。然后扩展至穗轴，病部枯褐，使被害部位以上小穗形成枯白穗，故又名红头瘴、烂麦头或白穗麦。
