水稻小秧育秧期间，会诱发秧苗发生病虫害，因此抓住秧田面积小、用药少、成本低的有利阶段，及时做好水稻秧田病虫防治工作，确保育出秧苗健壮、病虫害轻，抗逆性好。
一、小秧主要病害及防治技术
（一）、水稻立枯病：其发病的主要原因是气温过低、温差过大等因素引起，秧田在缺水情况下最易诱发该病（特别在3叶期最易发病），主要表现为出苗后秧苗枯萎，容易拔断，茎基部腐烂，发病较重的整片死亡，病株基部多长有赤色霉状物。
防治药剂：70%敌克松1000倍液于阴天或晴天下午喷雾防治；
（二）、水稻叶瘟病：秧田后期，杂交稻易发生叶瘟，开始在叶上产生暗绿色小斑，逐渐扩大为梭形，常有延伸的褐色坏死线，病斑中央灰白色，边缘褐色，外有淡黄色晕圈，叶背有灰色霉层，病斑较多时连片形成不规则大斑的慢性型病斑。或者在感病品种上形成暗绿色近圆形或椭圆形的急性型病斑，叶片两面都产生褐色霉层，条件不适应发病时转变为慢性型病斑。
防治方法：可用40%稻瘟灵100毫升或20%三环唑100克，兑水50公斤喷雾。
二、小秧主要虫害及防治技术
（一）、一代螟虫越冬代幼虫羽化产卵在秧田水稻叶片背面，蚁螟孵后为害叶鞘，选用杀卵、触杀兼有且渗透性强的药剂防治，此时效果较好；错过时机，螟卵或蚁螟将带入大田，防治成本加大。防治方法：20%三唑磷剂1000倍液喷雾防治。
（二）、其它害虫性
稻蝗也是稻田常发害虫，部分地区和田块仍可能偏重发生，因此要加强田间调查，密切注意其发生动态，及时在移栽大田前加以防治。防治方法：选用5%锐劲特30毫升或20%三唑磷剂1000倍液喷雾防治，可以兼治螟虫。
