小麦纹枯病在小麦不同生育时期，均可受感染，小麦出苗后，在土壤中越夏的病菌侵染麦苗的地下茎和茎基部叶鞘。到小麦返青后，受害麦苗基部叶鞘上出现浅褐色椭圆形或菱形病斑，中部灰色，边缘褐色，有的病斑轻度纵裂。
小麦进入拔节期以后，正是纹枯病侵略茎秆的时候，但在这一时期，由于小麦纹枯病主要发生在植株的茎基部，症状隐蔽，容易被人忽视而错过最佳防治时机。当病菌由叶鞘侵入茎秆后，常引起茎壁坏死变软，病部纵裂，植株失水枯死，遇到风雨天气，发生倒伏而造成严重减产。一般病田减产10％左右，重者可减产30％～40％。
一、选用中抗和耐病品种：目前生产上缺乏高抗纹枯病的小麦品种，秋种时尽量选用中抗、耐病或感病轻、丰产性好的品种。
二、合理轮作，加强田间管理：实行小麦与油菜、大豆、花生等轮作，减少田间菌源积累。适当降低播量，控制植株密度，增强麦田通透性。适当增施有机肥，平衡施用氮、磷、钾化肥，合理密植，及时除草和排水，改善麦田生态环境，培育壮苗，提高抗病性和补偿能力。
三、化学防治：以种子处理为重点，春季重病田喷药剂防治。
1、药剂拌种。当前施用效果较好的是用20%三唑酮乳油、25%三唑酮可湿性粉剂、15%羟锈宁可湿性粉剂、12.5%烯唑醇悬浮剂、3%戊唑醇湿拌剂等拌种，药剂用量为干种子量的0.02-0.03%。5.5%浸种灵2号乳油，每100公斤种子用药1克湿拌；或23%宝穗水乳剂，每100公斤种子用药20克湿拌。
2、喷雾。春季小麦病株率达20%的地块，应及时喷药，施药时间在小麦拔节初期，以阻止病害侵入茎秆。喷雾所用药剂可采用下列的一种：20%三唑酮乳油50毫升、15%或25%三唑酮可湿性粉剂分别为75克或100克，15%三唑酮可湿性粉剂75-100克、25%烯唑醇可湿性粉剂50-60克或12.5%烯唑醇悬浮剂100毫升等。
应采取农业措施与化防相结合的综防措施，才能有效地控制其为害。
1、选用抗病、耐病品种
如郑引1号、扬麦1号、丰产3号、华麦7号、鄂麦6号、阿夫、7023、8060、7909、鲁麦14号、仪宁小麦、淮849-2、陕229、矮早781、郑州831、冀84-5418、豫麦10号、豫麦13号、豫麦16号、豫麦17号、百农3217、百泉3039、博爱7422、温麦4号等。215953虽然病指高，但产量损失少。
2、施肥
施用酵素菌沤制的堆肥或增施有机肥，采用配方施肥技术配合施用氮、磷、钾肥。不要偏施、施氮肥，可改痒土壤理化性状和小麦根际微生物生态环境，促进根系发育，增强抗病力。
3、适期播种
避免早播，适当降低播种量。及时清除田间杂草。雨后及时排水。
4、药剂防治
①播种前药剂拌种用种子重量0.2%的33%纹霉净（三唑酮加多菌灵）可湿性粉剂或用种子重量0.03%-0.04%的15%三唑醇（羟锈宁）粉剂、或0.03%的15%三唑酮（粉锈宁）可湿性粉剂或0.0125%的12.5%烯唑醇（速保利）可湿性粉剂拌种。播种时土壤相对含水量较低则易发生药害，如每kg种子加1.5kg种子加1.5mg赤霉素，就可克服上述杀菌剂的药害。
②翌年春季冬、春小麦拔节期，亩用有效成分井冈霉素10克，或井冈·蜡芽菌（井冈霉素4%、蜡质芽孢杆菌16亿个/克）26克，或烯唑醇7.5克，或苯甲·丙环唑6－9克、或丙环唑10克。选择上午有露水时施药，适当增加用水量，使药液能流到麦株基部。重病区首次施药后10天左右再防一次。
5、生物防治
提倡施用南京农业大学研制的B#力粉拌种，防效可达60%以上，促进小麦种子发芽，增产13.7%。
