西芹烂心也是一种生理病害。开始是心叶的叶脉间变成褐色，以后因为周围细胞死亡而变成黑褐色，所以又称黑心病。主要发生在11-12片真叶长出以后，收获前1个月以内。
发生烂心的主要原因是缺钙。在酸性土壤上容易发生缺钙。或者土壤中并不缺钙，但是某些原因影响了钙的吸收，植株同样表现出缺钙症状。一般在高温、干旱、施肥过多的条件下发生。棚温过高、水分严重不足时，阻碍钙的吸收，也常发生烂心。土壤中氮、钾、镁过多，由于拮抗作用也会影响对钙的吸收，即使吸收以后，也不能很好地运转，心叶部分照样腐烂。土壤盐类浓度过高时，会影响钙的吸收，因此，肥料1次施用量不可过多。
缺硼也可发生烂心。缺棚的原因是土壤中有效硼含量偏低或由于拮抗作用而使植株不能正常吸收硼素。土壤ph值在7.1-8.1的范围内，硼的有效性降低，易发生缺硼症状。轻质土壤的有效硼含量常少于黏质土壤，轻质土壤发生缺硼的机率也较多。有机质含量过低的土壤，有效硼含量较少，也易发生缺硼。高温、干旱使土壤中硼的有效性降低，容易发生缺硼。土壤中氨态氮和钾素过多时，西芹吸硼困难。土壤中钙含量过多或不足时，影响西芹对硼素的吸收。
缺钙与缺硼造成烂心的症状足不同的。缺钙时生长点萎缩死亡，幼叶早期死亡常伴随嫩叶边缘焦灼病，小叶尖端叶缘扭曲。缺硼时沿着幼叶边缘向内逐渐褐变，最后心叶坏死。常伴随心叶叶柄内侧变成褐色井龟裂，外叶的叶柄老朽开裂导致茎折。
防止西芹烂心，应根据症状查清原因，采取相应的措施。缺钙时叶面喷洒0.5%的氯化钙或硝酸钙2-3次。缺硼时叶面喷洒0.2%-0.3%的硼砂或硼酸加0.3%的生石灰2～3次。同时，应注意调节棚室温湿度、追肥配比和土壤水分。要特别注意防止早害和湿害的发生。
