黄萎病和青枯病都是土传病，在移栽前要对土壤进行处理，可用敌磺纳等喷施土壤消毒，在苗期可用噁霉灵淋根可控制，同时尽量不连种。
茄子黄萎病发病初期，用80％噁霉灵.福美双800倍、或80％乙蒜素800倍等喷雾防治，重点对准患部喷透。5~7天一次，连续2~3次。青枯病，建议用多粘类芽孢杆菌、或77％氢氧化铜600倍、或20％噻森铜400倍等灌根，5~7一次，连续3~4次。
茄子黄萎病。用咯菌腈，或甲霜铜，或络氨铜锌，或噁霉灵，或枯草芽孢杆菌，或氯溴异氰脲酸，或敌磺钠，或五氯硝基苯等淋灌根部进行防治。
茄子青枯病，是细菌感染引起的病害，用中生菌素，或乙蒜素，或多抗霉素，或农用链霉素，或辛菌胺乙酸盐，或氯溴异氰脲酸，或春雷王铜，或噻菌铜，或噻森铜，或喹啉铜，或氢氧化铜，或氧化亚铜，或氧氯化铜，或甲霜铜，或络氨铜，或松脂酸铜等进行灌根防治。
茄子黄萎病、土传病害、尽量不要重茬种植，要通过嫁接预防、轮作倒茬预防，种植前土壤使用五氯硝基苯或者敌磺钠等药消毒杀菌、之后穴施生物菌肥移栽。生长期出现抓住发病初期使用恶霉灵加枯草芽孢杆菌加生根剂喷淋根部防治。
青枯病、细菌性病害，发病植株白天萎蔫，傍晚恢复，切开根部维管束发黑、挤压后有白色菌液。建议抓住发病初期使用噻菌铜或者农用链霉素或者中生菌素或者叶枯唑或者氯溴异氰尿酸或者松脂酸铜或者喹啉铜等药喷淋根部防治。发病严重的拔除、土壤撒施生石灰消毒杀菌。
