一、辣椒根系特点
辣椒的根系不如番茄、茄子发达。主根向下伸长，四周分生侧根，如此不断分杈，形成根系。根的主要作用是从土壤里吸收、贮存、输送水分和养分，供辣椒生长发育的需要。另外，还起固定植株、支持主茎不倒伏的作用。
辣椒的主根上粗下细，在疏松的土壤里，一般可入土层40～50厘米。移栽的辣椒由于主根被切断，生长受到抑制，深度一般为25～30厘米。随着主根的生长，不断生出侧根，在地面下5～20厘米深处分生的侧根最多，一般长约30～40厘米。侧根上再生小支根，组成根系网。育苗移栽辣椒主根受到抑制后，侧根发生早且多。整个根群主要分布在20厘米左右的表土层中。
二、辣椒茎的特点
辣椒茎直立，基部木质化，较坚韧，茎高30～150厘米，因品种不同而有差异。辣椒株丛较小，适于密植，主茎长到5～7片叶时顶端现蕾，在花芽下位发生侧叶芽，形成杈状分枝，在每个杈上又形成花芽和分杈并依次向上形成门椒、对椒、四门斗、八面风等，属无限分枝型。簇生椒属有限分枝型。
三、辣椒叶片的特点
辣椒叶是制造有机养料的工厂，它具有光合作用、蒸腾作用。辣椒的叶分为子叶和真叶。着生在茎、枝节上，幼苗时生长在茎上。分枝后，茎上叶脱落，渐生新叶于枝节上，逐步往上推移。
辣椒的叶由叶片和叶柄两部分组成。单叶、互生，呈卵圆形或长圆形、全缘、先端尖、叶面光滑、微具光泽。叶色因品种不同而有深浅之别。一般大果型品种叶片较大，微圆短；小果型品种叶片较小，微长。
四、辣椒花朵的特点
辣椒的花为完全花，自花授粉，也可异花授粉，异交率5％～30％，品种间差异较大。故辣椒采种时，应注意隔离，一般不少于500米。
辣椒花小，白色或绿白色。花的结构可分为花萼、花冠、雄蕊、雌蕊等部分。花萼为浅绿色，共有6片，包在花冠外的基部，花萼基部连成萼筒呈钟形。花冠由5～7片分离的花瓣组成，基部合生。花瓣较小，颜色呈乳白色。开花后4～5天，随着子房生长而逐渐脱落。雄蕊由5～7个花丝和花药组成，围生于雌蕊外面，与雌蕊的柱头平齐或柱头略高出花药，称为正常花或长柱花。还有一种花，柱头低于花药，称为短柱花。雌蕊由柱头、花柱和子房三部分组成。柱头上有刺状隆起，便于黏着花粉。一旦授粉条件适合，花粉发芽，花粉管通过花柱到达子房受精，形成种子。与此同时，果实也发育膨大。
五、辣椒果实的特点
辣椒果实属浆果。由子房发育而成，为真果。果形因品种不同而各异。果实多下垂生长，果皮与胎座离开，形成较大的空腔，果实有2～4个心室，用于着生种子。
辣椒果实从开花授粉至商品成熟需25～30天，生物学成熟约50~60天。
六、辣椒种子的特点
辣椒种子着生于果实的胎座上。成熟种子为扁平状，略呈圆形，淡黄色，有光泽，采种或保存不当时为黄褐色。种子千粒重5.25克。发芽能力平均年限为4年，使用适期年限为2~3年。
