追肥是对于每种农作物都不可缺少的，冬瓜也不例外，相对来说，在冬瓜的整个生长期中，追肥算是重要的一个阶段。南方地区追肥多用稀粪水，而北方则用充分腐熟的优质厩肥和化肥，整个生育期追施2~3次。前期追肥以氮为主，而中后期则以氮、磷、钾复合肥为主。冬瓜追肥时期因品种栽培方式不同而有差别。冬瓜多为直播栽培，底肥充足时，次追肥就不必过早。南方地区一般在第三真叶展平后，北方地区多在第5~6片真叶期进行次追肥。抽蔓期一般在蔓长1米左右和2米左右各追施一次稀肥，目的是促进茎蔓生长。第四次追肥是在开花结果期，这次施肥对冬瓜生长十分重要，一般在瓜坐住后进行，以防落花落果，同时氮、磷、钾肥料要齐全。冬贮冬瓜特别是大型果品种冬瓜，在采收前10~15天停止肥水供应，目的是减少瓜内水分，增加耐贮性。冬瓜的追肥应本着前少后多的原则，一般抽蔓以前，追肥量占30%左右，开花结果期占70%。追肥以穴施或条施为宜，每亩共需尿素45千克，过磷酸钙50千克，硫酸钾25千克，有条件的地区，追肥也可用优质有机肥(如豆饼，每亩75千克，稀粪水4000千克)。
