1.雌雄的缺陷或双性花形成的果实
在植株结果初期或后期，雌花形成过程中环境条件比较差（温度过高过低、水分供应不均等）雌花发育不完全，由此结成的果实畸形果的比例较高。如花芽分化遇低温，易结短小的果实。
2.花期遭遇异常天气
雌花开放期间在高温、干旱或低温多雨条件下，由于授粉、授精不完全而形成畸形果。如田间通风不良，白天气温出现36℃左右，瓜蒂发尖，果实发育正常部分种子较多不正常部分种子没有发育，导致形成尖果、歪果或果内种子没有发育以及种子分布不均等情况；在低温多雨下，单性结果时，果实常弯曲。
3.营养和水分不足或失调
如灌水不及时易出现细腰果；土质薄、基肥不足、前期缺肥后期“攻瓜肥”过多时则出现锤匠棒的畸形果；在植株生长差或后期生长衰弱或果实膨大期间水分不足易出现尖嘴果；在果实形成期间灌水量过大，长势过旺，失去了营养与生殖期之间的平衡，易出现细腰和大肚的果实，也会出现尖嘴的僵果。
4.植株营养不足
如霜霉病、细菌性角斑病虮蚰、蓟马发生，叶片同化能力降低，养分消耗反而增加；卷须仅仅是攀附作用，采用人工绑蔓，卷须只消耗了养分。
