番茄病害主要是早（晚）疫病、病毒病、叶霉病和灰霉病。
1.病毒病：是番茄的主要病害之一。蚜虫和白粉虱是传播病毒病的主要途径，近几年有烟粉虱传播的番茄黄化曲叶病毒病日趋严重，所以在育苗前期与生长后期注意防治虫害，可以使用50-60目防虫网防烟粉虱。
2.晚疫病：是一种发展迅速的病害，一旦发生，防治不及时很可能造成绝产绝收。冬春季节保护地湿度大、温度较适宜，疫病极易大面积流行。一定要做好田间预测和调查，提前进行预防；一旦发现，应立即喷药防治，同时结合放风排湿。常用药剂露速净、疫病清喷施。只要防治及时，用药得当，还是容易控制的。
3.灰霉病：冬春季节易发生，病症主要表现为花、幼果上先得病，湿度大时可造成流行。防治上应加强通风量，降低温度。在配制坐果调节剂时加入0.2%速克灵，防止灰霉病在花期及坐果期侵染。化学防治上一般采用灰克或特立克等进行喷雾。
4.叶霉病：此病主要为害叶片，在叶背形成淡绿色病斑，病重时病斑上长出灰色霉层，渐变成灰紫色至灰褐色。常用防治方法是通风排湿，并结合化学药剂如特立克、多霉清800倍液处理。
