芹菜黑腐病为真菌性病害，是芹菜主要病害之一。该病主要危害根茎部和叶柄基部，多在近地面处发病，有时也侵染根。发病后受害部先变灰褐色，扩展后变成暗绿色至黑褐色，后破裂组织变黑腐烂。叶下垂，呈枯萎状，病部生出许多小黑点。严重的外叶腐烂脱落，尤其根冠部易腐烂。
发病规律主要以菌丝附在病残体或种子上越冬。翌年播种带病的种子，长出幼苗即猝倒枯死，病部产生分生孢子借风雨或灌溉水传播，孢子萌发后产生芽管从寄主表皮侵入进行再侵染，生产上移栽病苗易引起该病流行。
防治方法：
1、防止重茬，实行轮作。2、培育壮苗：苗期适温为15—18℃，防止高温，适当控水，防止幼苗徒长，定植前7—10天要炼苗；幼苗定植后要少浇水，多松土，蹲苗促根，为丰产打下基础。3、科学管理：施足农家有机肥、生物肥、底肥施石灰100公斤（杀菌、调查PH值、补钙）；科学灌溉，小水勤浇，防止大水漫灌，降低田间湿度。越夏用遮阳网降温，减少阳光直射。及时清除田间病株，携出田外深埋或烧毁。
4、药剂防治：发病初期可选用75％百菌清可湿性粉剂700至800倍液，50％多菌灵可湿性粉剂800倍液，70％甲基托布津可湿性粉剂500倍液，77％可杀得可湿性粉剂500倍液喷雾，60％的防霉宝超微可湿性粉剂800倍液防治，每7至10天喷一次，连喷2至3次。
