水稻生殖生长期受干旱影响最大，移栽期次之。分蘖期干旱，生长受到抑制，甚至一部分叶片受旱枯死，但只要干旱持续时间不太长，一旦有了水，仍能很快恢复生长，对产量影响较小。
孕穗期，更精确地说是在花粉母细胞减数分裂期到花粉形成期。这个时期由于配子体的发育，新陈代谢旺盛，叶面积大，光合作用强，蒸发量大，是水稻一生中需水的临界期。受旱就会严重影响光合作用和对矿质养分的吸收，影响有机质的合成和转运，引起大量颖花形态败育和生理败育，形态败育减少了总颖花数，生理败育使花粉粒发育不健全、畸形、抽穗后不能受精而使稻粒成为空粒。
抽穗开花期发生干旱，会影响抽穗，造成包颈，或抽出的穗不舒展，开花不顺利，花粉生活力下降，甚至干枯死亡，或不能正常进行授粉，致使结实率降低，空壳率增加。
开花到成熟期干旱，主要破坏了有机物质向穗部的运输，使叶片的光合作用产物和叶鞘、茎秆中的贮藏物质向穗部运输困难，有些谷粒过早地停止灌浆而成瘪粒。干旱使根系吸收水分和养分的数量大为减少，矿物营养的运输无法正常进行，同时功能叶寿命缩短，过早枯黄，造成粒重降低，产量下降。
