辣椒落花落果的原因很多，综合起来，主要是由于营养不良，阴天、雨天过多，空气湿度过大、低温或高温，及病虫危害等因素造成。
如营养不良：土地贫瘠、肥水不足；氮肥施用过多或栽培密度过大，而造成植株徒长，使营养生长和生殖生长失去平衡，使辣椒花、果营养不足而脱落。
不利的气候条件：遇有连续阴雨光照不足，温度偏低或偏高，湿度过大，这些不利条件导致辣椒花不能正常授粉，易造成落花落果。
病虫危害：辣椒发病也会引起落花落果。如辣椒感染病毒后，常出现死顶现象，造成落花落果；烟青虫、棉铃虫蛀果，也易造成辣椒落果。
防治措施：生产上培育壮苗，适时定植，合理密植，科学施肥，氮磷钾配合施用，供应充足肥水，利用保护地栽培来防止不利天气影响，加强病虫害防治。叶面喷施氨基酸等叶面肥。
