美国薄壳山核桃的特点是树体高大，寿命长，嫁接树的结果年限可达百年以上，最长的可达500年以上，因而合理的树形就显得尤为重要。在自然生长条件下的薄壳山核桃，初期的树形多为圆锥形。人工整形时，一般采用主干疏层型。早期利用合理的修剪方法，培养起健壮、结构合理的骨架。结构合理是指中央领导干明显强壮、主枝开张，枝条的大小、数目、层次关系合理，能丰产且能承载负荷。
在我国，一般定干高度在1~1.5米。苗木定植后，因长势较强，在主干上部可抽生2次枝，可以利用它选出第一层主枝，以后可随着中央领导干的延长，每年选留1层主枝。薄壳山核桃至15年生左右时，树高可达5米以上，为管理方便，可落头开心，使树冠不再继续增高。进入结果期以后，树冠逐渐增高，大枝数量增多，可分年疏剪多余大枝；对不能再利用的徒长枝，也应及时疏除。对于较下垂的结果枝组，要及时回缩复壮，适当短截，但修剪量仍应从轻。当相邻树的主枝发生轻度交叉重叠时，可以利用疏枝回缩的方法修剪，但严重时只有进行间伐疏密了。
根据修剪的时期不同，可分为休眠季修剪和生长季即夏季修剪。休眠季修剪可提前或推后，也可在冬季进行。为了早果丰产，更应该重视夏季修剪。夏季修剪易于操作，修剪量小，有利于缓和树势。常用修剪方法有疏枝、短截、回缩、摘心、枝条变向等。枝条变向包括拉枝、撑枝、别枝等。若伤口较大，要涂消毒剂和保护剂。消毒剂可用2%硫酸铜溶液。保护剂可直接用油漆涂抹。
薄壳山核桃树种是隔年结果倾向明显的树种。进入结果盛期后，常表现大年时超载，小年严重时没有产量。不同品种大小年结果的表现不同，有的品种表现严重，有的品种不明显。负载量过重会导致当年花芽形成少及树体养份积累少，来年产量低。同时，也会大大降低当年坚果的品质。超负载有时会导致主枝劈裂折断。必须通过修剪或疏花、疏果，使负载合理，才能实现连年丰产、稳产、优质，获得高效益。
经历若干年后，核桃园内会出现枝条密挤现象，使园内的通风透光条件恶化，加重核桃园的病虫害，降低坚果的品质和产量。这时应该进行疏伐。疏伐时要尽量疏伐那些树形差、病虫危害重，产量低而不稳的单株，疏伐后尽量使所保留单株在园内分布均匀，应保留适当比例的授粉树。疏伐的强度，以核桃园内的光能利用合理为宜
