在田间黄瓜靶斑病容易被误诊为霜霉病或细菌性角斑病。鉴别时可以注意以下特征：霜霉病、细菌性角斑病的病斑边缘都呈水浸状，早晨尤为明显。而典型的靶斑病病斑边界清楚；霜霉病、细菌性角斑病的病斑扩展受到叶脉的限制，会呈多角形，而靶斑病的病斑略呈圆形（特别是发病初期）；湿度大时霜霉病斑在叶背面长出灰黑色霉层，比较稀疏，细菌性角斑病则在叶背溢有乳白色浑浊水珠状菌脓，干后有白痕，靶斑病病斑正反面产生灰褐色霉层。另外，黄瓜上还可能发生由链格孢属或假尾孢属真菌引起的叶斑病，由于防治技术相似，不必严格区分。
黄瓜靶斑病可以随种子，包括嫁接南瓜种子传播，但更多的是病菌以分生孢子、厚垣孢子或菌丝体随病残体在土壤中越冬，翌年产生分生孢子，借气流或雨滴飞溅传播。该病害为高温高湿型气传病害。昼夜温差大，结露时间长，植株衰弱，偏施氮肥的地块发病重。
