一、施肥原则
即在培肥土壤的基础上，通过土壤微生物的作用来供给作物养分，要求以有机肥为主，辅以生物肥料，并适当种植绿肥作物培肥土壤。
二、肥料使用方法
根据肥料特点及不同的土壤性质、不同的蔬菜种类和不同的生长发育期灵活搭配，科学施用，才能有效培肥土壤，提高作物产量和品质。
基肥：结合整地每亩施腐熟的厩肥或生物堆肥3000—5000千克，有条件的可使用有机复合肥作种肥。方法是在移栽或播种前，开沟条施或穴施在种子或幼苗下面，施肥深度以5—10厘米较好，注意中间隔土。
追肥：追肥分土壤施肥和叶面施肥。土壤追肥主要是在蔬菜旺盛生长期结合浇水、培土等进行追施，主要使用人粪尿及生物肥等。叶面施肥可在苗期、生长期选取生物有机叶面肥，每隔7—10天喷1次，连喷2—3次。绿肥一般都在花期翻压，翻压深度10—20厘米，每亩翻压1000—1500千克，可根据绿肥的分解速度，确定翻压时间。
微生物肥料使用方法：把微生物肥料中大量有益的微生物加入到作物根际和土壤中，改善根际生态环境，提高供肥水平，降低农产品中亚硝酸盐含量。依靠微生物的活动使作物增产，通常有拌种、基肥和追肥三种方法。
使用时一要保证有足够数量的有效微生物，二是具备适宜有益微生物生长的环境条件。适宜的土壤环境条件和营养条件是微生物肥料中有益微生物大量繁殖与发挥作用的重要前提。一般要求：土壤疏松，通气良好；及时排灌，水分适量；温度适宜；土壤ph值6.6—7.5；有足够的有机能源。
三、生产有机蔬菜允许使用的有机肥料种类
动植物的粪便；植物沤制肥；绿肥。如草木樨、紫云英、田菁、紫花苜蓿等；草木灰、饼肥；通过有机认证的有机专用肥和部分微生物肥料；部分矿物质（包括钾矿粉、磷矿粉和氯化钙等物质）。
四、注意的问题
1、人粪尿及厩肥要充分发酵腐熟，最好通过生物菌沤制，并且追肥后要浇清水冲洗。另外，人粪尿含氮高，在薯类、瓜类及甜菜等作物上不宜过多施用。
2、秸秆类肥料在矿化过程中易于引起土壤缺氧，并产生植物毒素，要求在作物播种或移栽前及早翻压入土。
3、有机复合肥一般为长效肥料，施用时最好配施农家肥，以提高肥效。
4、硫酸钾在有机蔬菜生产上准许使用，但限量。硫酸钾应与有机微生物菌肥混合使用，可转化为生物钾。
