所谓不打农药的病虫害防治一般称为农业防治，是相对于化学防治的一种防治方法。是为防治农作物病、虫、草害所采取的农业技术综合措施、通过调整和改善作物的生长环境，以增强作物对病、虫、草害的抵抗力，创造不利于病原物、害虫和杂草生长发育或传播的条件，以控制、避免或减轻病、虫、草的危害。对于棉花而言，常用的农业防治方法有以下几种。
一、合理作物布局，改善耕作制度
合理布局、轮作倒茬，加强中耕除草，增施充分腐熟的有机肥，及时拔除病株、摘除病叶，保持棉田清洁，降低病虫源数量。棉花合理调控，不旺不衰，健康栽培，能极大的减少病虫害的发生机率。加大防护林建设力度，改善农区生态环境，以利天敌的生栖。科学调整作物布局，合理安排耕作制度，达到增益减害的目的。扩大抗病虫的棉花新品种种植面积。大力推广棉田生态带种植,达到增益控害的目的。
二、铲埂除蛹
铲埂除蛹是消灭虫源的有效途径，为消灭虫源，减少虫口基数。是一项行之有效的防治病虫害的措施，也为即将到来的春耕春播工作奠定基础。棉铃虫和地老虎等虫害喜欢在向阳田埂边越冬，红蜘蛛早春也会在田埂杂草上出蛰繁殖。在棉花播种前后，及时清理田间地头地边的杂草，将田边地埂铲除虚土，培土修埂，能减少棉铃虫、地老虎、红蜘蛛等虫害的发生。
三、铲除杂草
铲除杂草有些害虫在棉花收获后，常常转移到田间及周围杂草上越冬，而到早春，这些杂草又往往成为越冬害虫繁殖危害的“庇护所”和寄主。有关专家曾在棉田周围的杂草上作过调查，每平方米竟有越冬地老虎8～15头，棉红蜘蛛在早春杂草寄主上，百株虫（卵）量高达1194头。因此，冬春结合积肥造肥，铲除田内外杂草，或者在早春对杂草进行喷药处理，是防治越冬害虫的有效措施。
四、棉田深翻
冬季深翻既是棉花增产的重要措施，也是消灭越冬棉铃虫的有效方法。冬耕时间越早越好，一般在前茬作物收获后就要抓紧进行，在大地封冻前（冻土层超过5厘米）耕完，以延长风化时间，提高灭虫效果，并有利于多接纳雨雪。耕翻深度一般应在10厘米以上。冬耕越深，灭虫效果越好。
五、棉田冬灌
冬耕后接着冬灌，不仅能沉实、风化土壤，而且能提高越冬蛹的死亡率。据中国农科院研究，土壤相对含水量在40%时，棉铃虫蛹死亡率为35.7%，成虫羽化率为40%；土壤含水量在70%时，棉铃虫蛹死亡率为46.7%，成虫羽化率为33.3%；当土壤含水量达到饱和状态时，蛹的死亡率为100%。另有资料表明，冬耕冬灌的地块，棉铃虫蛹越冬死亡率在80%左右，只耕不灌的地块越冬死亡率为60%～70%，不耕不灌的地块只有30%～40%。
