安全贮存蔬菜种子，首先种子质量要高，其次贮存的温、湿度要恰当。蔬菜种类繁多，种子特性各舁。蔬菜大多数为天然异交作物或常异交作物，在田间很容易发生生物学变异，除了栽植时注意留种田的隔离外，在采收种子时应严格选择。需经后熟的种子，如甘蓝、花椰菜，菠菜、凉薯等，要后熟处理。种子入库前应充分晒干，含水量达到安垒贮存的标准水平。蔬菜品种很多，同类蔬菜品种之间很难从种子外形加以区别，故从收获到种子出仓全过程严防机械混杂，贮藏袋内外挂上标签。
贮藏期间控制温、湿度。一般蔬菜种子贮藏温度以控制在20-25℃以下，空气相对湿度保持在60%以下为宜。种子生活力的降低是随着贮存期间温度和湿度的增高而逐渐加快，因此，夏、秋季气温过高时，早、晚要注意通风：干燥天气也应早，晚通风，阴雨天，关闭门窗，防止潮气进入。
贮藏方式，象薯芋类贮藏量大采用窖藏法外，一般用麻袋或容器贮藏。留种数量较多的，如豆类、萝卜、瓜类等用麻袋，堆积高度要适宜，一般不宜超过6袋。夏季及贮藏初期，堆放高度减低一半以上。小量种子，可采用坛缸、罐，铁箱之类容器，容器内先袋入生石灰或其他干燥剂。为防止仓虫危害，每袋可按种子重量放入0.05%的樟脑丸，然后密闭仓库，对防虫有显著效果。贮藏过程中应经常检查，发现问题及时处理。
