1.农业防治
前茬作物收获后，及时深翻，可降低虫口，减轻危害。利用斑潜蝇的趋光性，可用黑光灯诱杀成虫，用机油和黄油混合涂于黄色板上，插到田间，粘飞动的成虫，每亩插黄色板20-30块。
2.药剂防治
由于斑潜蝇幼虫潜叶危害，所以必须做好虫情的预测预报，抓住产卵盛期至孵化初期的关键时期及早防治。可选用48%乐斯本乳油1000倍液，20%潜蝇宝乳油3000倍液，2.5%功夫乳油2000-3000倍液，1.8%阿维菌素乳油3000倍液，75%潜克5000倍液，5%锐劲特悬浮剂1000倍液。针对幼虫取食汁和叶肉的特点，可在药液中加入500倍的消抗液（害利平、消虫亡），也可加入适量的白酒，以提高药效。为防止产生抗药性，以上农药要交替使用。
