在育苗的初期是在黑暗或弱光条件下进行的。播有萝卜种的栽培盘应放在育苗架上培育，栽培盘叠放在一起，3至4个一摞，每昼夜浇水5至6次，每次浇水更换栽培盘的方向和上下的位置，每摞用黑色薄膜或双层遮阳网遮光，幼芽长到1.5厘米左右，可将上面盖的无纺布揭下，并在浇的水中添加营养液，在浇液的同时，改换育苗盘的方向，以免萝卜芽的生长因见光和浇液不均匀向一边倾斜。当芽长到2至3厘米时，不能叠盘，栽培盘单层放在立体栽培架上，或平放到地面上，搭架盖黑膜或遮阳网遮光。当芽生长到10至12厘米时，将黑膜或遮阳网揭掉，让萝卜芽见光生长。这样1至2天，幼苗由白变绿完成绿化过程。在管理过程中也可以使幼苗遮光软化，出土后立即采收上绿下白，品质更佳。
在生长过程中，萝卜芽生长密度大，温度过高，叶子上会产生黑色小麻点。如有发生时，则采用浸水法补水，将容器底浸入水面湿润的无纺布，叶面上不再增加湿度，叶面小麻点严重时，应及时销毁，以防传染。
