南方水稻黑条矮缩病应采取以“农业防治为基础、‘治虱防矮’为重点、应急补救为补充”的综合防治策略。关键是“治虱防矮”。抓好秧田期和本田初期防治关键时期，在传毒媒介白背飞虱传毒之前将其消灭，控制病毒传播，并辅以其他措施，达到防控南方水稻黑条矮缩病的目的。
一、推行农业防治
1、清除杂草。用除草剂或人工清除的办法对秧田及大田边的杂草进行清除，减少飞虱的寄主和毒源。
2、避免种植本地区上年度南方水稻黑条矮缩病重发品种。
3、推广防虫网覆盖育秧。即播种后用40目聚乙烯防虫网全程覆盖秧田，阻止稻飞虱迁到秧苗上传毒为害。
4、适当增施磷钾肥，加强肥水管理，提高植株抗病能力。
5、适当加大播种量，合理密植或预留备用苗。
二、实施“治虱防矮”
采取“抓前期保后期，抓秧田保大田”的“治虫防病”策略，重点抓好秧田和本田分蘖期之前白背飞虱的预防和控制工作。
1、种子处理。在水稻播种时实行药剂浸种或拌种，减轻白背飞虱的危害。浸种浓度为10％优质吡虫啉300—500倍液，浸种12小时；拌种处理要求在种子催芽露白后用10％高渗吡虫啉可湿性粉剂10g先与少量细土或谷糠拌匀，再均匀拌1kg(以干种子计重)种子即可播种。
2、秧田避虫。秧田应远离感病稻田和玉米田；采用防虫网覆盖保护或集中保护育秧。
3、健身栽培。水稻田翻耕犁耙减轻病虫源技术，适时播种，培养无病虫壮秧；合理密植，历史发生区适当加大播种量，移栽时剔除疑似病株，田间发现感病植株要及时拔除或踩入泥中，减少本田毒源，并从健株上掰蘖补苗，重病田要及时翻耕改种；及时排水晒田，避免重施偏施氮肥等，创造不利于白背飞虱发生的生态环境，减轻病虫为害。
4、药剂防治。药剂防治应本着治早、速效与持效的原则。
①、秧苗防治。在秧苗一针一叶期用噻嗪酮或吡蚜酮兑水喷雾；在移栽时实行带药移栽，施“送嫁药”或移栽时浸秧。
②、大田防治。在拔节期前，如遇白背飞虱迁入峰，且带毒率高，选用噻嗪酮、吡蚜酮、醚菊酯、吡虫啉等药剂防治白背飞虱。
三、加强田间检查，采取应急补救措施
1、对发病秧田，要及时剔除病株，并集中埋入泥中，移栽时适当增加基本苗。
2、对大田发病率2%～20%的田块，及时拔除病株（丛），并就地踩入泥中深埋，然后从健丛中掰蘖补苗。对重病田及时翻耕改种，以减少损失。
