一、选用抗病品种。用无病新土育苗，采用营养钵分苗。选择5年以上未种过瓜类蔬菜的地块种植，与其他蔬菜实行轮作。
二、施用充分腐熟肥料，减少伤口。
三、浇水时做到小水勤浇，避免大水漫灌。结瓜期应分期施肥，忌施入未腐熟的人粪尿。
四、苗床用50%多菌灵可湿性粉剂8克/平方米处理畦面。每亩用50%多菌灵可湿性粉剂4千克，混入细干土，拌匀后施于定植穴内。用30%恶霉灵水剂600-800倍液，在播种时喷淋1次，播种后10-15天再喷淋1次，本田灌根2次，在移栽时灌根1次，15天后再灌根1次。
五、在枯萎病发病前或发病初期在发病初或发病前及时药剂防治，药剂可用：50%多菌灵可湿性粉剂500倍液、或2%农抗120水剂200倍液灌根，每株用药液0.25千克，隔7-10天灌1次，连灌3次，防治效果较好。另据室内抑菌试验表明，菇渣和鸡粪浸提液对黄瓜枯萎病的抑菌效果较好。
