1、大豆花叶病的病叶症状在叶片上呈典型的花叶症状，一般在嫩叶上花叶症状明显，而在老叶上则常不明显。常见的花叶症状有三种：一是重花叶型，病叶呈黄绿相间的斑驳，皱缩严重，叶脉褐色弯曲，叶肉呈泡状突起，暗绿色，整个叶片的叶缘向后卷曲，后期叶脉坏死，植株矮化。二是皱缩花叶型，病叶呈黄绿相间的花叶而皱缩，叶片沿叶脉呈泡状突起，叶缘向下卷曲常使叶片皱缩呈歪扭的不正型，植株矮化，结荚少。三是轻花叶型，叶片生长基本正常，肉眼观察有轻微淡黄色斑驳，摘下病叶透过日光见有黄绿相问的斑驳。一般抗病品种或后期感病植株多表现此症状。
2、大豆苗期症状一般是在真叶上出现明脉现象，不久变为花叶状，病株节间缩短，植株矮化。种子带毒植株矮化较重，而后期由蚜虫传毒感病的植株则矮化现象不明显。
3、大豆籽粒上病斑症状常从脐部开始出现放射状或不规则形的褐色或黑色斑纹，斑纹的有无和轻重与感病时期有关，带毒种子长出的病株所结的种子斑纹明显，种子传播带毒率高，后期由蚜虫传毒而感病的植株，特别是开花以后感病的植株，种子上的斑纹常不明显。但种子带毒与否并不完全决定于斑纹的有无，无斑纹的种子并不一定不带毒。
