1、采收熟度
在果实生长大小定型进入重量成熟阶段后，无论重量、糖酸含量以及类胡萝卜素的含量都迅速增加，它们对品质和风味影响极大。所以采青(全果青色)对商品品质十分不利，采黄(全果橙黄色)的果实已进入衰老期，对运销同样不利。
2、冷害
菠萝冷害的临界温度为6-10℃，视品种而异。同一品种，熟果比青熟果可忍受低3℃左右的低温。受害果果心变褐，维生素C减少，果肉味淡，易烂。
3、机械伤与病害
菠萝采后主要病害是黑腐病。病菌为弱寄生性真菌，从伤口侵入。所以，采收时果柄的伤口以及采后处理运输装卸过程中造成的机械损伤，都是引致微生物病害的主要原因，必须尽量减少。