玉米生育中、后期，主要病、虫害有纹枯病、穗腐病和玉米螟（即钻心虫）等。玉米被害后，导致减产降质。
玉米中、后期病虫害的防治，除及时清除病株、残叶，减少病原、虫源，疏通田间"三沟"，搞好健身栽培外，重要的是克服玉米植株高大、田间郁闭的困难，适时进行药剂保护。
当玉米大喇叭口期（心叶期），每亩用5%井冈霉素可溶性粉剂200克，拌无菌细土20-25公斤撮施于玉米大喇叭口内，不仅防效高，成本低，持效期长，简便易行，而且井冈霉素系生物农药，对人、畜安全，无残留，对天敌也无不良影响，还可克服水源缺乏的困难和操作麻烦两大难题。采用井冈霉素毒土1次性撮施于心叶，不仅对纹枯病的防治效果可达85.8%，比同等用量1次性喷雾的效果高出12.4个百分点，比两次喷雾的效果也高出5.1个百分点。直到玉米成熟期，防治效果仍能达到71.2%-86.6%，而且还可兼治玉米穗腐病，其效果可达86.3%。这是由于药土撮心法，药土撮入玉米喇叭口内，药土集中，不会流失，有利于玉米植株缓慢吸收；而喷雾则由于在喷雾过程中，至少有20%左右药液流失，因而药效较差。若在毒土中混拌杀菌剂（如稻瘟净）、杀虫剂（如敌敌畏、杀螟丹）等，则可兼治多种病虫，一举多得。
当雌穗灌浆中、后期，玉米钻心虫会钻入果穗中咬食籽粒，每亩可用50%敌敌畏乳油0.4公斤，对水10公斤，喷雾或用棉球均匀涂抹在雌穗顶端和花丝上，亦可收到同样的防治效果。
