一个具有良好性能的膜下滴灌系统，除了科学的、合理的设计和正确的使用之外，还要有精心的维护，才能达到预期的效果。为了更好地发挥膜下滴灌系统的优势，还必须在维护方面注意以下问题。
1清洗沉淀池
膜下喷灌系统使用一段时间以后，沉淀池的底部会有很多的砂石沉积，四壁上也会有少许的藻类浮生。如果积累地过多，有可能进入灌溉系统。所以，我们要经常地清洗一下沉淀池。清洗前先将池中的水排出，打扫池底的沙石和沉淀池四周的藻类植物。
2离心过滤器反冲洗
对离心过滤器要及时地进行反冲洗，因为经过一段时间过滤，离心过滤器污物堵塞程度不断增加，使过滤出的水流逐渐变小，进出口的压差增大。离心过滤器可通过手动控制来操作水流换向阀，实现反冲洗的过程。
离心过滤器反冲洗时，关闭其中一个过滤罐上的三向阀门，同时也就是打开了该罐的反冲洗管进口，由另一过滤罐来的干净水通过集水管进入待冲洗罐内，水流反向流过砂床时，使砂床膨胀向上，砂粒之间间距增大，被截流在孔隙之间的各种污物被水冲动，并带出砂床、经反冲洗管排出。
在冲洗污物过程中，不可避免地要丧失一些过滤砂，必须及时补充新砂，使砂层保持足够的厚度，以保证过滤效果。
3清洗网式过滤器
网式过滤器的清洗比较容易，将过滤器打开，拿出圆形的筛网，放到清水中，用刷子刷去附着的污物，再将圆形筛网安装到过滤器中。
4检查及清洗滴灌头
在日常的灌溉过程中，我们要留意滴灌头的流水情况，注意流水的强度和均匀度，检查滴灌头有无堵塞，管子有无破裂的地方。滴灌头的堵塞会造成喷洒不均匀，而管道破裂会造成局部灌溉水太多，这些都会影响蔬菜和作物的生长。
如果发现灌溉头有堵塞的现象，可以用清水清洗。
