一、棉花疫病苗期危害症状：棉花苗期发病，根部及茎基部初呈红褐色条纹状，后病斑绕茎一周，根及茎基部坏死，引起幼苗枯死。子叶及幼嫩真叶受害，病斑多从叶缘开始发生，初呈暗绿色水渍状小斑，后逐渐扩大成墨绿色不规则水渍状病斑。在低温高湿条件下迅速扩展，可延及顶芽及幼嫩心叶，变黑枯死；在天晴干燥时，叶部病斑呈失水褪绿状，中央灰褐色，最后成不规则形枯斑。叶部发病，子叶易脱落。
二、棉花疫病铃期危害症状：棉花铃期发病，在棉株中、下部果枝的棉铃上发生，多雨天气也能高达上部果枝的棉铃。病害多从棉铃苞叶下的果面、铃缝及铃尖等部位开始发生。初生淡褐、淡青至青黑色水浸状病斑，病斑不软腐，湿度大时病害扩展很快，整个棉铃变为有光亮的青绿至黑褐色病铃。在多雨潮湿时，棉铃表面可见一层稀薄白色霜霉状物，即病菌的孢囊梗和孢子囊。发生疫病的棉铃很快会诱发其他铃病，使病铃表面成为红、黄、灰、黑等不同颜色，掩盖了疫病的症状。尚未发育成熟的青铃发病，易腐烂或脱落，有的成为僵铃。疫病发生晚者虽铃壳变黑，但内部籽棉洁白，及时采摘剥晒或天气转晴仍能自然吐絮。
